Штейн, чьё состояние всё сильнее искажает восприятие, пытается выбрать собственный путь. Крона и Мари собираются искать Медузу и вернуть его, тогда как ученики сомневаются в решениях академии, но не отказываются от борьбы с Асурой. Параллельно Джо исследует книгу Эйбона: работа с инструментом ещё не окончена, и поиски недостающего знания идут рядом с поисками исчезнувшего преподавателя.

Премьера серии — 19 января 2009 года. В оригинале серия называется «クルクルクルル 〜博士は踊る、新しき世界?〜».